先週はスペインで行われたSMASH 2013に参加してきました。
最先端の研究発表が聞けたのと、
Mnova開発元であるMestrelabとのミーティングで
有意義な時間を過ごしてきました。
飛行機を3本乗り継いでいく旅 (出張)は
体には少々辛いものの、
途中の国や街に立ち寄ることができて楽しいものです。
http://systemplus.co.jp/mnova/
2013年9月30日月曜日
2013年9月18日水曜日
アポダイゼーション 3 (Apodization)
Mnovaには多くの窓関数が用意されています。
Exponential
Gaussian
Sine Bell
Sine Bell Square
TRAF
Trapezoidal
Parabolic
Hanning
Convolution Difference
Linear Ramp
など。
これらのパラメーターを自由に設定でき、
組み合わせて使うことで、
ユーザの求める処理が可能です。
各窓関数では、
FIDのどの部分の影響を強調し、どの部分の影響を減少させるのかを決めます。
大まかに特徴を書くと、
FIDの初期部分を強調すると、
メリット
・ S/Nが良くなる(感度向上)
デメリット
・ 線幅が広くなる(分解能低下)
FIDの終端部分を強調すると、
メリット
・ 分解能が向上する
デメリット
・ ノイズが強調され、S/Nが悪くなる
FIDの中期部分を強調すると、
メリット
・ シャープな成分を強調できる(分解能向上)
デメリット
・ FIDの初期部分の強度が落ちる(ピーク強度が落ちる)→定量性が失われる
などなどが挙げられます。
これらのメリット・デメリットを組み合わせて
目的に応じた処理を行ってください。
http://systemplus.co.jp/mnova/
Exponential
Gaussian
Sine Bell
Sine Bell Square
TRAF
Trapezoidal
Parabolic
Hanning
Convolution Difference
Linear Ramp
など。
これらのパラメーターを自由に設定でき、
組み合わせて使うことで、
ユーザの求める処理が可能です。
各窓関数では、
FIDのどの部分の影響を強調し、どの部分の影響を減少させるのかを決めます。
大まかに特徴を書くと、
FIDの初期部分を強調すると、
メリット
・ S/Nが良くなる(感度向上)
デメリット
・ 線幅が広くなる(分解能低下)
FIDの終端部分を強調すると、
メリット
・ 分解能が向上する
デメリット
・ ノイズが強調され、S/Nが悪くなる
FIDの中期部分を強調すると、
メリット
・ シャープな成分を強調できる(分解能向上)
デメリット
・ FIDの初期部分の強度が落ちる(ピーク強度が落ちる)→定量性が失われる
などなどが挙げられます。
これらのメリット・デメリットを組み合わせて
目的に応じた処理を行ってください。
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2013年9月17日火曜日
アポダイゼーション 2 (Apodization)
そもそもアポダイゼーションって何?
Apodization : 足切り
と訳されます。
何を足切り?
FIDがデータ取得時間内に収束しなかった場合、
FIDの後半を単調減少関数で収束させることを
アポダイゼーション処理と言います。
つまり、FIDの後半部分を足切りしたということですね。
Mnovaでは、
FIDに関数をかける代表的な処理方法のアポダイゼーションを
コマンド名にしています。
日本語訳コマンドでは、
「アポダイゼーション(窓関数)」としていますが、
窓関数とは…
フーリエ変換というのは、
無限時間の信号に対して行うものですが、
実際にはそんな計算はできません。
そこで、適当な時間範囲の信号に対して計算を行います。
その適当な時間範囲の時間波形(NMRの場合はFID)を窓に見立てて、
様々な関数を掛けて処理していきます。
窓に対してかける関数処理なので、窓関数と呼びます。
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Apodization : 足切り
と訳されます。
何を足切り?
FIDがデータ取得時間内に収束しなかった場合、
FIDの後半を単調減少関数で収束させることを
アポダイゼーション処理と言います。
つまり、FIDの後半部分を足切りしたということですね。
Mnovaでは、
FIDに関数をかける代表的な処理方法のアポダイゼーションを
コマンド名にしています。
日本語訳コマンドでは、
「アポダイゼーション(窓関数)」としていますが、
窓関数とは…
フーリエ変換というのは、
無限時間の信号に対して行うものですが、
実際にはそんな計算はできません。
そこで、適当な時間範囲の信号に対して計算を行います。
その適当な時間範囲の時間波形(NMRの場合はFID)を窓に見立てて、
様々な関数を掛けて処理していきます。
窓に対してかける関数処理なので、窓関数と呼びます。
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2013年9月13日金曜日
アポダイゼーション 1 (Apodization)
プロセッシング行程
FIDに
・ドリフト補正
・トランケート
・窓関数(アポダイゼーション)
・ゼロフィリング & 線形予測
を施し、
フーリエ変換 時間波形から周波数波形に変換
横軸を周波数 or ppmに返還したら、
・位相補正
・ベースライン補正
・スムージング
の中の窓関数(アポダイゼーション)とは何をしてるのでしょうか?
フーリエ変換する前のFIDにある関数(窓関数)を掛けて波形を変えます。
なぜ、関数をかけて波形を変えるのでしょうか?
関数を掛けてFID波形を変えると、
S/N比を向上させたり、スペクトルの分離を良くしたりすることができます。
こういった利点があるので、
関数をかける(窓関数(アポダイゼーション))というひと手間かけて処理します。
このFIDにかける関数というのはいくつかあるのですが、
各関数の使い分けはまた別途。
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FIDに
・ドリフト補正
・トランケート
・窓関数(アポダイゼーション)
・ゼロフィリング & 線形予測
を施し、
フーリエ変換 時間波形から周波数波形に変換
横軸を周波数 or ppmに返還したら、
・位相補正
・ベースライン補正
・スムージング
の中の窓関数(アポダイゼーション)とは何をしてるのでしょうか?
フーリエ変換する前のFIDにある関数(窓関数)を掛けて波形を変えます。
なぜ、関数をかけて波形を変えるのでしょうか?
関数を掛けてFID波形を変えると、
S/N比を向上させたり、スペクトルの分離を良くしたりすることができます。
こういった利点があるので、
関数をかける(窓関数(アポダイゼーション))というひと手間かけて処理します。
このFIDにかける関数というのはいくつかあるのですが、
各関数の使い分けはまた別途。
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2013年9月12日木曜日
言語設定
Mnovaでは複数の言語を切り替えて使用することができます。
編集 \ ユーザ設定 \ 一般タブ \ インターフェース ¥ 言語
(Edit \ Preferences \ General Tab \ Interface \ Language)
で使用する言語を切り替えます。
選択できる言語は
English
Spanish
Japanese
Russian
Chinese
の5つから選択できます。

日本語で使用する場合は、
Japaneseを選択し、OKボタンを押します。
その後、Mnovaを再起動すれば、
コマンドが日本語に切り替わって使用することができます。
しかし、
新たなプラグインや新たなコマンドで
日本語が不十分や不適切な場合があります。
システムプラスからMnovaをご購入いただくと、
それらの問題を解決した日本語訳でMnovaを使えるようにいたします。
実は・・・
「システムプラスの日本語訳でMnovaを使いたい」と
我々からご購入いただくユーザも多くおられ、
好評をいただいてます。
http://systemplus.co.jp/mnova/
編集 \ ユーザ設定 \ 一般タブ \ インターフェース ¥ 言語
(Edit \ Preferences \ General Tab \ Interface \ Language)
で使用する言語を切り替えます。
選択できる言語は
English
Spanish
Japanese
Russian
Chinese
の5つから選択できます。

日本語で使用する場合は、
Japaneseを選択し、OKボタンを押します。
その後、Mnovaを再起動すれば、
コマンドが日本語に切り替わって使用することができます。
しかし、
新たなプラグインや新たなコマンドで
日本語が不十分や不適切な場合があります。
システムプラスからMnovaをご購入いただくと、
それらの問題を解決した日本語訳でMnovaを使えるようにいたします。
実は・・・
「システムプラスの日本語訳でMnovaを使いたい」と
我々からご購入いただくユーザも多くおられ、
好評をいただいてます。
http://systemplus.co.jp/mnova/
2013年9月11日水曜日
プロパティ (Properties)
グリッドの線太さや色、ラベル文字のフォントや大きさ等々、
スペクトル上のあらゆる特性の変更をプロパティ (Properties)で行えます。
・メインメニュー 編集 \ プロパティ (Edit \ Properties)
・スペクトル上でダブルクリック
・スペクトル上で右クリック \ プロパティ (Properties)
のいずれかを実行すると、
ダイアログボックスが開きます。
プロパティ (日本語使用の場合)

Properties (英語使用の場合)
ちなみにユーザ設定画面同様、上記プロパティは
システムプラスよりご購入いただいたMnovaユーザのみが
使用できる画面です。
http://systemplus.co.jp/mnova/
スペクトル上のあらゆる特性の変更をプロパティ (Properties)で行えます。
・メインメニュー 編集 \ プロパティ (Edit \ Properties)
・スペクトル上でダブルクリック
・スペクトル上で右クリック \ プロパティ (Properties)
のいずれかを実行すると、
ダイアログボックスが開きます。
プロパティ (日本語使用の場合)

Properties (英語使用の場合)
ちなみにユーザ設定画面同様、上記プロパティは
システムプラスよりご購入いただいたMnovaユーザのみが
使用できる画面です。
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2013年9月10日火曜日
ユーザ設定 (Preferences)
他のソフト同様、Mnovaでもユーザが使いやすいように設定を変更できます。
メインメニュー 編集 \ ユーザ設定 (Edit \ Preferences)を実行すると、
ダイアログボックスが開きます。
ユーザ設定 (日本語使用の場合)
Preferences (英語使用の場合)
ここで操作に関する各種設定を変更することができます。
ちなみに、上記ユーザ設定画面は
システムプラスよりご購入いただいたMnovaでの画面です。
また、スペクトルのフォントやグリッドの変更は
メインメニュー 編集 \ プロパティ (Edit \ Properties)で行えます。
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メインメニュー 編集 \ ユーザ設定 (Edit \ Preferences)を実行すると、
ダイアログボックスが開きます。
ユーザ設定 (日本語使用の場合)
Preferences (英語使用の場合)
ここで操作に関する各種設定を変更することができます。
ちなみに、上記ユーザ設定画面は
システムプラスよりご購入いただいたMnovaでの画面です。
また、スペクトルのフォントやグリッドの変更は
メインメニュー 編集 \ プロパティ (Edit \ Properties)で行えます。
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